בבית הספר פועלות שכבות לימוד החל משלב חטיבת הביניים כיתות ז'-ט' וכן חטיבה עליונה כיתות י'-י"ב. הגימנסיה מאפשרת מסלולי לימוד מגוונים ביניהם:
בית הספר פועל בתכונת שש שנתית, כאשר בין ערכיו ומטרותיו של בית הספר הוא קידום הישגי התלמיד במגוון מסלולי ומקצועות לימוד, מתן מענה לצרכים הרגשיים של התלמיד, הטמעת תחומים ערכיים וחברתיים, ופיתוח דמות בוגר.[1]
הגימנסיה מפעילה שלושה מסלולי לימוד הכוללים:
מסלול מדעי (הכולל את מגמות הכימיה, פיזיקה, ביולוגיה וערבית).
המסלול העיוני (הכולל את מגמות: חינוך-גופני, תיאטרון, אומנות ומדעי החברה).
המסלול הטכנולוגי ( הכולל את מגמות הנדסת תוכנה, תקשורת וניהול עסקי, הנדסת מערכות ורובוטיקה.
אגף שח"ר (כיתות מב"ר ואומ"ץ).
בגימנסיה פועלת נבחרת הרובוטיקה SYNCMORE. הקבוצה זכתה בתחרויות רבות בארץ ובעולם ביניהם מקום שני בתחרות רובוטיקה בינלאומית, בקטגוריית תכנות הרובוט בארקנסו שבארצות הברית 2019,[2] ב-2022 זכתה הקבוצה באליפות הארצית בתחרות ה-FLL,[3] עוד ב-2022 זכתה הקבוצה מקום השני בפרס ערכי הליבה, ופרס מעוררת ההשראה בתחרות הבינלאומית לרובוטיקה ביוסטון, טקסס.[4]
קבוצת הספורט של הגימנסיה, נבחרת הכדוריד, המורכבת מתלמידי מגמת החינוך הגופני, זכתה בתחרויות, אליפויות ופרסים רבים. עד 2023 מחזיקה הנבחרת בכ-10 גביעים של משחקי הגמר של אליפות התיכוניים בכדוריד.[5] ב-2018 נבחרת הכדוריד של גימנסיה קציר מחולון, זכתה באליפות העולם לבתי ספר, אשר התקיימה בדוחא בירת קטאר.[6]