אגן או אגן מבני הוא שקעגאולוגי נרחב שראשיתו בתנועת לוחות טקטוניים שיצרה קער בשכבותסלע, בו מצטברים משקעים חדשים העשויים במהלך הזמן למלא את הקער. עם זאת, פעילות טקטונית עשויה ליצור אגן לאחר תהליכי השקעה קודמים.
התבוננות במפה גאולוגית מראה כי צורתם הכללית של האגנים היא מעגלית או אליפטית, מעין קערה, ושכבות הסלע בו קונצנטריות. מאחר שהאגנים עמוקים יותר במרכזם, השכבות הנחשפות בהם צעירות יותר ככל שמתקרבים למרכז.
מונחים
אגן מתיחה (pull-apart basin) – אגן הנוצר באזורים בהם התרחשה מתיחה לאורך העתק