במטבח של הקהילות היהודיות הגדולות של האזור, כמו בכל שאר המקומות בעולם, משתמשים במטבח המקומי, תוך הכנסת השינויים היהודיים המתבקשים: כשרות, חגים ומועדים, טקסים וכללי השבת.
מסורת
האוכל הבוכרי עמד ומאז ומתמיד במרכז החיים בבית ובמרכז תרבות האירוח של העדה.
המטבח הבוכרי התבסס על מצרכים טריים וזמינים במרכז אסיה. עיקר מטעמי המטבח בנויים מאורז לבן המשולב עם ירקות טריים, המבושלים בקדירה למשך זמן ממושך עם מנה נכבדה של שומן מן החי ומעט צמחי תבלין. לצד מאכלי הקדירה יש מגוון של טוגנים, מרקים ייחודיים ומנות בשריות (בעיקר בשר עוף ובשר בקר).
מאכלים אופייניים
גושגיז'דה (או סאמסה) הוא שם של מאפה בוכרי מסורתי, העשוי מבצק ממולא בבצל ובבשר החתוך לקוביות קטנות מאוד (או מבשר טחון).
המאכל שנחשב למאכל הלאומי של העדה הבוכרית נקרא פלוב (אושפלאו), תבשיל בוכרי חגיגי האהוב על בני העדה ועל רבים אחרים. פלוב משלב בין גזר, עוף, בשר ואורז. יש המוסיפים למאכל זה צימוקים או חומוס. ניתן להכין פלוב עם עוף ללא הבשר. השלב הראשון בהכנתו נקרא בשפה הבוכרית טף – טיגון הבצל, העוף, הבשר והגזר. השלב השני הוא סידור שכבות האוכל בסיר ובישול האורז שהוא בסיס המאכל.
החמין - גם במטבח יהודי בוכרה, כבכל מטבח יהודי קיים החמין, שנקרא גם אוסובו (אוכל של שבת) ומכיל בעיקר אורז. כמו בכל חמין יש לכל משפחה תוספות משלה, יש המוסיפים שעועית וחומוס ויש המוסיפים גם משמשים, תפוחי עץ ותמרים, טאדאגי זה החלק השרוף של האושסבו שנדבק לסיר. גרסה נוספת של המאכל, הנקרא חלטי סבו, מתבשלת בשקיק מיוחד בסיר מים רותחים, בה בנוסף לאורז יש גם צימוקים ובשר קצוץ.
המנטו - (נקרא גם מנטי) אחד המאכלים הנפוצים אצל הבוכרים הוא המנטו, המנטו עשוי מכיס בצק בתוכו בשר קצוץ ובצל המנטו מתבשל על סיר אדים זמן הבישול הוא כ-45 דקות, הבישול על סיר האדים הוא בסיס במאכל.
כבכל מטבח יהודי, גם למטבח הבוכרי יש מתכון אופייני להכנת דגים הנקרא מיאי ביריון (דג מטוגן). ההכנה פשוטה ביותר: כל שיש לעשות הוא לקמח את הדג ולטגן אותו, אך התוספת של המטבח המקומי היא שלאחר הטיגון ולפני ההגשה טובלים את הדגים ב"אווי-סיר" (מי שום וכוסברה), המעניקים לדגים טעם מיוחד.
מאכל מסורתי ומפורסם במטבח הבוכרי הוא באחש המאופיין באורז הירוק שלו ומורכב בעיקר מאורז, מבשר, חתיכות כבד, מתבלינים ומכוסברה (ניתן להוסיף גם תרד, שמיר ופטרוזיליה אשר נותנים למאכל את צבעם הירוק).
סירקניז, בנוסף לבאחש, גם הוא מאכל ייחודי למטבח יהודי בוכרה. מורכב מאורז, חומוס, גזר ושום.
המתכון לפורים הוא סמוסה פוריו - בצק מטוגן ממולא בדלעת, בשר או שניהם. הבוכרים נוהגים לאכלו בפורים בגלל צורת חיתוכו כמשולשים המזכירה את צורת אוזן המן.
גם בני העדה הבוכרית נוהגים להכין תבשילים חלביים לכבוד חג השבועות, כמו מאכל הנקרא בבוכרית קיצ'ירי, תבשיל שהכנתו קצרה וקלה, ובו אורז ועדשים ועליו מוזגים רוטבשום או רוטב חלבי. תבשיל זה נהוג להכין גם בתשעת הימים לפני צום תשעה באב, עקב המנהג שלא לאכול מאכלי בשר מראש חודש אב עד לאחר צום תשעה באב, סימן לאבלות על חורבן בית המקדש.