נהר וילוי (ברוסית: Вилюй) הוא נהר במזרח סיביר שברוסיה, הזורם ברובו ברפובליקת סאחה, מזרחה עד למפגש עם נהר הלנה, מצפון מערב ליישוב סנגאר (אנ').
בחורף, מאוקטובר ועד מאי הנהר מכוסה קרח. בחודשי הקיץ עוברות בנהר ספינות המשנעות אספקה ליישובים לאורך הנהר. בקרבת הנהר יש אגמים רבים. הנהר גם מתאפיין בדגה עשירה.
תחנת כוח שנבנתה על הנהר היא בעלת הספק של 650 מגה ואט. הקמת תחנת כוח נוספת הופסקה בשנת 2008 כאשר הופעלו 3 יחידות ייצור מ-4 שהיו מתוכננות. החשמל המיוצר מנוצל במכרות יהלומים ופחם באזור.
