Sa flotte est actuellement équipée de 6 Boeing 737 d'ancienne génération. Elle possédait des Saab 340 pour les vols internes, mais a très vite abandonné ce service. Elle possédait également un Airbus A321 jusqu'à la fin 2018.
Auparavant, la Yanair avait comme base l'aéroport de Aéroport international de Kiev (Jouliany), situé en centre-ville de Kyiv. Elle change de hub début 2019 avec la réouverture du Terminal F de l'aéroport international de Boryspil.
Actuellement la compagnie opère également au Mali sur la ligne Bamako-Gao.