Il se marie, perd ses deux premières femmes, Cora LeRoy et Carrie Tomlinson, puis épouse Mme John Bower, sœur de sa première femme. De 1865 à 1869, il est collecteur des recettes internes de l'Iowa.
Il recommande que le Congrès fixe au premier mai le début de l'exercice fiscal, met en place les préparatifs des rapports annuels des commandants de poste et propose des mesures pour protéger le parc national de Yellowstone. En il visite fort Ellis, dans le territoire du Montana et entreprend un voyage de deux semaines dans le parc de Yellowstone, parcourant le trajet de l'expédition Washburn de 1870. Son guide pour ce voyage est le lieutenant Gustavus Cheyney Doane, qui avait été en garnison à fort Ellis et avait été le chef de l'escorte militaire de l'expédition Washburn[2].
Il est destitué (impeachment) par un vote unanime de la Chambre des représentants des États-Unis peu après avoir démissionné sur une accusation de corruption[3]. Le président de la Chambre des représentants des États-Unis, Michael C. Kerr(en), écrit au Sénat des États-Unis pour indiquer cette démission avait été réalisée dans l'intention d'échapper à la procédure de destitution engagée contre lui[4]. William Belknap est jugé par le Sénat, qui se déclare compétent à se saisir de cette affaire par un vote de 37-29, même si William W. Belknap avait déjà démissionné[5]. Le vote sur sa condamnation échoue de loin à réunir les deux tiers des voix requis, avec 35 voix contre 37 pour chaque article et 25 voix contre chacun. Deux parmi ceux qui votèrent sa condamnation, 22 de ceux qui votèrent pour son acquittement et une abstention, estiment que le Sénat est incompétent, du fait de la démission[6].
↑Frank Browning et John Gerassi, Histoire criminelle des États-Unis, Nouveau monde, , p. 287
↑(en) Orrin H. Bonney, Battle Drums and Geysers-The Life And Journals Of Lt. Gustavus Cheyney Doane, Soldier And Explorer Of The Yellowstone And Snake River Regions, Chicago, Swallow Press, , p. 47–50