Wilhelm Brückner-Rüggeberg fait ses études à Munich, où il est l'élève d'August Schmid-Lindner et de Siegmund von Hausegger. En 1836 et 1937 il est chef invité à l'Opéra de Hambourg et en devient chef permanent en 1938 jusqu'en 1871.
Il enseigne à la Hochschule für Musik de Hambourg à partir de 1955.
Il est autant réputé comme chef d'orchestre que comme chef de chœur.