Selon Nunes et al. (2005), le génome d'OROV se compose de trois segments d'ARN simple brin, enroulés en sens négatif, le grand (L), le moyen (M), le petit (S). Ces ARN sont programmés pour encoder une grande protéine (L : activité polymérase), glycoprotéines virales de surface (Gc et Gn), et une protéine NSM non structurelle, ainsi que les nucléocapsides (N) et les protéines NSS. Les séquences complètes de nucléotides ont été déterminées pour l'ensemble des trois segments d'ARN, et les premières études de biologie moléculaire du gène N (SRNA) de 28 souches différentes d'OROV ont montré l'existence de trois génotypes, nommés I, II et III[3].
La circulation du virus a été mise en évidence dans plusieurs pays d'Amérique centrale et du Sud : Argentine, Brésil, Panama, Pérou et Trinité-et-Tobago. Plusieurs épidémies ont été rapportées au Brésil, dans les États du nord et du centre[4].
En septembre 2020, 37 cas compatibles avec le virus d'Oropouche ont été détectés à Saül (centre de la Guyane française), dont 7 confirmés par RT-PCR. Avec un nombre d'habitants compris entre 50 et 80 à cette date, le taux d'incidence pourrait avoisiner les 50 à 70 %[5].
Début on observe une recrudescence de la prévalence du virus, avec déjà 5 530 cas au Brésil (contre 836 pour toute l'année 2023). La Bolivie, la Colombie et le Pérou connaissent également une hausse. Traditionnellement endémique du bassin amazonien, le virus est désormais présent parmi des populations éloignées de la forêt tropicale. En mai, Cuba a signalé ses premiers cas[6].
↑(en) Sofia Moutinho, « A little-known virus on the rise in South America could overwhelm health systems », Science, vol. 384, no 6700, (DOI10.1126/science.zsbcmzz).