Veniamin Mandrykin est formé à l'académie des jeunes du FK Alania Vladikavkaz en 1997 et devient professionnel à 17 ans.
En 1998, il fait ses débuts en championnat russe pour le club d'Alania avec lequel il fait finalement 46 apparitions avant de rejoindre le CSKA Moscou en 2002.
Veniamin Mandrykin a représenté la Russie dans différentes section d'âges, en 1998, il joue la coupe d'Europe des moins de 18 ans et a 12 capes en équipe de moins de 21 ans.
Le , Veniamin Mandrykin percute un arbre après avoir tenté d'échapper à un contrôle de police. Il s'en sort avec une fracture vertébrale et des blessures à la moelle épinière. Ses deux passagères (deux femmes, âgées de 19 et 20) sont plus légèrement blessées. Deux de ses coéquipiers du FC Dinamo Briansk qui étaient eux aussi dans la voiture, Maksim Fiodorov et Marat Magkeyev, s'en sortiront presque indemnes.
En février 2011, Veniamin Mandrykin était encore en soins intensifs. Il passe sous traitement en avril. Pour le soutenir, ses coéquipiers de FC D. Briansk, ont commencé leur premier match de la saison avec des maillots à son effigie, où il était marqué « Nous sommes ensemble ! Tu vas guérir ».