Le sous-marin fut commandé le à Dantzig (Danziger Werft), sa quille fut posé le , il fut lancé le et mis en service le , sous le commandement de l'oberleutnant zur SeeHanns-Ferdinand Massmann.
Conception
Unterseeboot type VII, l'U-409 avait un déplacement de 769 tonnes en surface et 871 tonnes en plongée. Il avait une longueur totale de 67,10 m, un maitre-bau de 6,20 m, une hauteur de 9,60 m, et un tirant d'eau de 4,74 m. Le sous-marin était propulsé par deux hélices, deux moteurs Diesel F46 de six cylindres produisant un total de 2 060 à 2 350 kW en surface et deux moteurs électriques Siemens-Schuckert GU 343/38-8 produisant un total 550 kW, en plongée. Le sous-marin avait une vitesse en surface de 17,7 nœuds (32,8 km/h) et une vitesse de 7,6 nœuds (14,1 km/h) en plongée. Immergé, il avait un rayon d'action de 80 milles marins (150 km) à quatre nœuds (7,4 km/h ; 4,6 milles par heure), en surface, son rayon d'action était de 8 500 milles nautiques (soit 15 700 km) à dix nœuds (19 km/h).
L'U-409 était équipé de cinq tubes lance-torpilles de 53,3 cm (quatre montés à l'avant et un à l'arrière) et embarquait quatorze torpilles. Il était équipé d'un canon de 8,8 cm SK C/35 (220 coups) et d'un canon anti-aérien de 20 mmFlak. Son équipage comprenait 48 sous-mariniers.
L'U-409 coula quatre navires marchands pour un total de 24 961 tonneaux, un navire de guerre de dix tonnes (transporté à bord d'un navire de transport) et a endommagé un navire marchand de 7 519 tonneaux au cours des six patrouilles qu'il effectua. Le sous-marin a également participé à six Rudeltaktik.