Il réalise sa première patrouille, quittant le port de Kristiansand le sous les ordres de l'Oberleutnant zur SeeGünther Link. Après cinq jours de mer, l'U-240 est porté disparu le dans la Mer du Nord à l'ouest de la Norvège.
Il n'y a pas d'explication à cette disparition. Les cinquante membres d'équipage sont morts[1].
Chris Bishop, historien militaire (trad. de l'anglais par Christian Muguet), Les sous-marins de la Kriegsmarine : 1939-1945 : le guide d'identification des sous-marins [« The spellmount submarine identification guide : Kriegsmarine U-boats 1939-1945 »], Paris, Éd. de Lodi, , 192 p. (ISBN978-2-84690-327-1, OCLC470721805, BNF41298980)