Il était censé devenir couvreur comme son père, mais en 1984, il a appris la guitare avec son modèle André Olbrich (future guitariste du groupe Blind Guardian) sans y montrer de réel talent. Un jour, il s'est assis derrière une batterie, a donné un véritable show si bien qu'on lui a conseillé d'abandonner la guitare et de devenir batteur.
Après peu de temps il devint batteur de Lucifer's Heritage, prédécesseur de Blind Guardian.
Son jeu de batterie dominant a fortement influencé la sonorité de Blind Guardian.
Savage Circus
En mars2005, il quitte le groupe à cause des "différences musicales" souvent évoquées, quoiqu'il soutienne tout ce qu'il a fait avec Blind Guardian (Thomen dans une interview dans l'EMP (magazine)). Les deux bords affirment qu'ils se sont séparés amis.
Avec Piet Sielck (Iron Savior), Jens Carlsson (Persuader) & Emil Norberg (aussi Persuader), il fonde un nouveau groupe nommé Savage Circus dont les sonorités ressemblent à celles chéries par Thomen dans les albums Somewhere far beyond (1992) & Imaginations from the other side (1995) de Blind Guardian.
Le , le groupe annonce qu'il se sépare de Thomen, ceci dû à des annulations répétitives de concerts à cause de lui.