En 1989, Ian Broudie commence à enregistrer seul sous le nom de Lightning Seeds. Le nom est une déformation d'un vers de Raspberry Beret de Prince. Broudie fut membre du groupe Care au milieu des années 1980, mais en 1989, il est beaucoup plus connu en tant que producteur pour les groupes de Liverpool, notamment Echo and the Bunnymen, ou encore de l´album Veuillez rendre l'âme (à qui elle appartient) de Noir Désir, et beaucoup d'autres labels indépendants à l'époque.
Sorti le , le single Pure du premier album Cloudcuckooland atteint le top 20 britannique. Il entre aussi dans le top 40 du Billboard Hot 100 américain. Pure et All I want atteignent le top 10 du Alternative Songs.
Broudie reprend sa carrière de production après le succès du premier album de Lightning Seeds, mais il revient à la chanson en 1991 et passe de Rough Trade à Virgin. Il demande à Simon Rogers de collaborer en studio pour la production, les arrangements et l'instrumentation. Rogers, qui avait également contribué à la programmation du premier album de Lightning Seeds, continue d'être le partenaire de Broudie pendant le reste de la carrière de Lightning Seeds.
L'album Sense en 1992 comprend la chanson The Life of Riley, écrite par Broudie pour son fils, qui atteint le 28e place du UK Singles Chart. Une version instrumentale de la chanson devient plus tard mieux connue comme le thème du concours Goal of the Month de BBC Television. L'album Sense voit les premières collaborations d'écriture de chansons de Broudie avec l'ancien chanteur de The SpecialsTerry Hall. Le titre de l'album Sense est co-écrit par Hall.
Broudie signe les Lightning Seeds chez Epic Records, met d'autres projets de côté et se lance dans un programme de tournées.
À la fin de l'année 1993, il enregistre Jollification qui sort le et comprend des collaborations avec Terry Hall, Alison Moyet et Ian McNabb. La tournée promotionnelle débute en , Broudie est le seul membre permanent du groupe. La tournée bénéficie du succès du deuxième single de l'album Change, qui atteint la 13e place du UK Singles Chart, devenant ainsi le deuxième succès du groupe au Royaume-Uni. Elle est reprise pour la bande originale du film Clueless.
Au cours de cette période, un certain nombre de chansons sont enregistrées dans un studio privé dans une péniche, Eel Pie Studios, alors détenu par Pete Townshend pour le quatrième album studio Dizzy Heights. Le single Ready or Not atteint le top 20 du UK Singles Chart.
En 1997, Lightning Seeds prend part au Hillsborough Justice Concert, qui se tient au stade Anfield de Liverpool, pour recueillir des fonds pour les familles dans leur lutte pour la justice. Au cours de cette période, le groupe obtient trois autres succès au Top 20 du Royaume-Uni, dont une reprise de The TurtlesYou Showed Me, qui devient l'un de leurs plus grands succès. Elle a une carrière internationale en faisant partie de la bande originale d’Austin Powers. Suivent l'anthologie Like You Do... et une tournée promotionnelle dans le Royaume-Uni. En 1998, Broudie refait et enregistre une version mise à jour de Three Lions pour la Coupe du monde de football de 1998 en France[1]. Three Lions '98 est à nouveau numéro 1 du UK Singles Chart. The Lightning Seeds joue au Glastonbury Festival et V Festival.
L'album Tilt en 1999 s'oriente vers la danse et présentait des collaborations avec Stephen Jones.
Pris par d'autres projets, notamment une carrière solo, Broudie met fin aux Lightning Seeds en 2000.
Le deuxième best of du groupe paraît le avec une nouvelle version de Three Lions. En 2009, Sony produit une nouvelle collection de chansons sous le titre Four Winds, mais l'album est refusé puis sort chez Universal.