Sébastien Inigo est formé dans un premier temps au SU Agen, dans la foulée de son frère Vincent[2].
Il rejoint ensuite l'Aviron bayonnais où il termine sa formation, et où il commence sa carrière professionnelle en 2006[1].
En 2007, il s'engage avec l'US Colomiers, alors que le club vient d'être relégué en Fédérale 1[3],[4]. Il participe à la remontée immédiate du club en Pro D2 en 2008[5]. Il met un terme à sa carrière de joueur en 2019, après 257 matchs joués avec le club haut-garonnais[6].
Après l'arrêt de sa carrière sportive, il lance une entreprise de production audiovisuelle avec son frère Vincent[7].