Né en Alaska, il grandit dans le Tennessee d'où ses parents sont originaires et où ils retournent alors que le petit Stan n'a que deux ans. Alors qu'il a 12 ans, la famille s'installe de nouveau à Anchorage.
À la fin de sa vingtaine, fascinée par la culture esquimaude, Stan Jones décide de vivre quelque temps dans la communauté iñupiat de Kotzebue. Il retourne ensuite à Anchorage, tente brièvement de vivre à Fairbanks, puis s'installe définitivement à Anchorage où il devient journaliste. À ce titre, il couvre le désastre écologique causé, le , par le naufrage du pétrolierExxon Valdez sur le Bligh Reef dans le sud de l'Alaska. Ses articles lui valent plusieurs prix de journalisme d'enquête.
En 1999, il publie L'Homme qui tue les gens (White Sky, Black Ice), premier roman policier d'une série ayant pour héros l'agent fédéraliñupiat Nathan Active.
Il a également publié en 2009 The Spill: An Oral History of the Exxon Valdez Disaster, un essai d'histoire orale sur le désastre du Exxon Valdez sur le Bligh Reef.
