Sarah Rafferty grandit dans le quartier de Riverside de Greenwich, au Connecticut.
Sa mère est présidente du département d'anglais de l'école du Couvent du Sacré-Cœur, et son père, Michael Griffin Rafferty Jr., a fait carrière en finance et dans la peinture[1].
Elle a trois sœurs aînées, Maura, Ann et Constance.
Elle est mariée depuis 2001 à Aleksanteri Olli-Pekka Seppälä, analyste de recherche de titres dans l'unité de gestion d'actifs de Lazard Frères & Company, à New York. Le couple se marie à l'église catholique romaine de Sainte-Marie à Greenwich, Connecticut[2]. Ils ont deux filles, Oona Gray (née le ) et Iris Friday (née en )[1],[3].
Sarah Rafferty est depuis longtemps une amie très proche de l'acteur Gabriel Macht, avec qui elle partage l'affiche de la série à succès Suits : Avocats sur mesure entre 2011 et 2019. Ils se sont rencontrés au Williamstown Theatre Festival de 1993[4].
Le , elle est présente, comme une grande partie du casting de Suits, au mariage royal du Prince Harry et de Meghan Markle, collègue et amie de travail[5].