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L'action se déroule dans la ville imaginaire Megakat City en proie à des malfaiteurs sous le contrôle de Dark Kat. Deux chats anthropomorphes Chance « T-Bone » Furlong and Jake « Razor » Clawson ont pour mission de rétablir l'ordre.
Système de jeu
Le jeu consiste en 5 niveaux[1] qui débutent avec un message du maire Manx, le long desquels les héros doivent affronter les vilains Dr. Viper, Mad Kat, le Maître du Passé, les Metallikats, et finalement Dark Kat. Certains niveaux se déroulent en pilotant le Turbokat Fighter.