En 1970, il fait fonction de curé de la paroisse de Pitelová, mais le régime communiste lui refuse l’autorisation d'exercer et jusqu'en 1982 il doit travailler comme conducteur de tracteur ou comme chauffeur de camion. Durant cette période, il organise néanmoins la construction dans son village natal d'une nouvelle église.
D' à Mgr Baláž préside la Conférence des évêques slovaques.
Mgr Rudolf Baláž est connu pour la fermeté avec laquelle il donnait son opinion sur les politiciens, même catholiques. Sous le gouvernement de Vladimír Mečiar il a défendu publiquement le président Michal Kováč dans son conflit avec le HZDS et s'est opposé aux mesures contre les minorités hongroises et roms. Il a alors été accusé de complicité sur des trafics d’œuvre d'art (dont il a été par la suite complètement blanchi)[2]. Il a également critiqué l'ancien gouvernement démocrate-chrétien de Mikuláš Dzurinda (sur les rapports avec le Vatican) et la présidente du gouvernementIveta Radičová (sur l'IVG)[3].
Il meurt subitement dans son bureau le d'une embolie artérielle pendant une réunion[3]. Il est enterré à Nevoľné.
