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Entre 1996 et 1999, Rubén Díaz de Cerio se distingue chez les amateurs en obtenant plusieurs victoires et diverses places d'honneur. Il évolue ensuite au niveau professionnel durant quatre saisons au sein de l'équipe Euskaltel-Euskadi. Avec cette formation, il obtient ses meilleurs résultats au printemps 2001 en terminant troisième d'À travers le Morbihan et cinquième du Tro Bro Leon.