Le lac la Truite (longueur : 2,4 km ; altitude : 355 m) constitue le plan d'eau de tête de la rivière Saint-Cyr.
À partir du lac la Truite, la rivière Saint-Cyr coule sur :
2,6 km vers le sud-ouest, jusqu'à la décharge (venant du nord-ouest) du lac Fontaine (altitude : 314 m) ;
2,0 km vers le sud, jusqu'à la décharge (venant de l'est) du lac Nuage (altitude : 312 m) ;
3,3 km vers le sud-ouest, jusqu'à la décharge (venant de l'ouest) du lac Braun (altitude : 300 m) ;
2,2 km vers le sud, jusqu'à la décharge (venant du nord-ouest) du lac Bory (altitude : 288 m) ;
360 m vers le sud, jusqu'à l'embouchure de la décharge (venant du sud-est) du lac Sérien (altitude : 267 m ;
2,5 km vers le sud-ouest, jusqu'à la décharge (venant du nord) du lac Bonpland (altitude : 301 m) ;
2,3 km vers le sud, jusqu'à la rive nord du lac Aberdeen ;
1,2 km en traversant vers le sud le lac Aberdeen (longueur : 0,4 km ; altitude : 212 m) ;
5,0 km vers le sud, jusqu'à l'embouchure de la rivière Boom (venant du nord) lequel draine notamment le lac de la Touche (altitude : 168 m) ;
1,0 km vers le sud-est en traversant des rapides, jusqu'à la décharge (venant du nord-est) du lac Walls (altitude : 190 m) et du lac des Amis (altitude : 274 m) ;
2,6 km (ou 1,4 km en ligne directe) vers le sud en passant à l'ouest de la Réserve éconologique James-Little et en zigzaguant jusqu'à l'embouchure.
La rivière Saint-Cyr est un affluent de la rive nord-est de la rivière des Outaouais. L'embouchure de la rivière Saint-Cyr est situé presque en face de l'embouchure du ruisseau Tee (Tee Creek - Ontario), à 4,1 km en aval de Rapides-des-Joachims et à 1,1 km en aval de Point Stewart (Ontario).
Toponymie
L'ancienne appellation de la rivière était ruisseau Boom West, par opposition à la branche est désignée ruisseau Boom dans ce bassin versant.