(à partir de la confluence) Rivière Hall, ruisseau Dégelé, rivière Duval, ruisseau Murphy, ruisseau Creux, décharge du Lac à Fred, décharge du Petit Lac Robidoux et du Lac Robidoux, ruisseau de la Coulée See, rivière Garin, rivière Reboul, ruisseau Cotton, ruisseau Mourier, ruisseau Triangle,
· Rive droite
(à partir de la confluence) Ruisseau de l'Entonnoir, ruisseau Jaune, ruisseau Rotten, ruisseau Whiskey, décharge du Lac à William, ruisseau de la Pipe, La Petite Ouest, ruisseau MacPherson, Rivière Bonaventure Ouest
La rivière Bonaventure se jette dans le barachois de Bonaventure sur la rive nord de la baie des Chaleurs. Cette dernière baie s'ouvre vers l'Est sur le golfe du Saint-Laurent.
Étymologie
Les Micmacs appelaient la rivière Bonaventure, la « Wagamet », ou eau claire.
La limpidité de son eau en fait l’une des belles rivières à saumon atlantique et omble de fontaine du Québec par ses résultats de pêche, et l’une des plus agréables rivières canotables en Amérique du Nord[4]. Depuis 1980, avec l’avènement de la loi sur les zones d’exploitation contrôlée (Zec), la gestion de l'activité de pêche sportive au saumon a été léguée à l'association des pêcheurs sportifs de la Bonaventure. Elle procure du travail à plus de 50 personnes de la région, dont 20 emplois directs[5].
Chaque année plusieurs milliers d’amateurs fréquentent la rivière soit pour pêcher, soit pour faire du canot ou du kayak ou simplement contempler la nature. Chaque année, plus de 20 000 plaisanciers descendent la rivière à bord d'embarcations non motorisées.
La rivière prend sa source dans le massif des Chic-Chocs, à 662 m d'altitude et à une dizaine de kilomètres (en ligne directe) au nord d'un petit lac du même nom. Encaissée dans le relief sur la majeure partie de son trajet, elle capte notamment les eaux de la rivière Bonaventure Ouest, sur la rive droite, à 182 m d'altitude, et, sur la rive gauche, celles de six affluents mineurs dont la rivière Garin, jusqu’à son embouchure dans la baie des Chaleurs, la rivière Bonaventure d’une longueur de 115 kilomètres offre des paysages des plus diversifiés, un débit constant et des rapides de classe I à III.
Les chemins d'accès sur la Bonaventure sont assez bien indiqués et entretenus sur la portion aval de la rivière, soit de la baie des Chaleurs jusqu'à l'embouchure de la rivière Bonaventure Ouest au km 65 (aussi nommée Big Ouest). Par contre, les chemins d'accès sur la partie amont de la rivière (du km 115 à 65) ne sont pas entretenus et cette portion de la rivière est difficile d'accès, tant au niveau navigation que de qualité de route.
1,7 km vers le sud-ouest, jusqu'à la confluence du ruisseau Jaune (venant de l'Ouest) ;
1,4 km vers le sud-est, jusqu'à au pont de la "route de la rivière » ;
3,7 km vers le sud, en croisant successivement l'île de la rivière Hall, l'île de la Fourche, l'île Formento et l'île des Sapins, jusqu'à un pont routier, jusqu'au pont du chemin de fer du Canadien National ;
1,4 km vers l'ouest, croissant trois îles dont l'île Arsenault, jusqu'au pont de la route contournant le barachois par le Nord-Est et traversant sur les trois îles précédentes ;
0,8 km vers le sud, jusqu'au pont de la route 132 dont le terrassement coupe le barachois en deux parties ;
0,7 km vers le sud, jusqu'à l'embouchure du barachois de Bonaventure.
La rivière Bonaventure contourne l'île des Chardons et se déverse sur la rive nord du barachois de Bonaventure, lequel s'ouvre par le Sud sur la rive nord de la Baie-des-Chaleurs. Ce barachois est traversé d'Est en Ouest par la route 132 laquelle longe le littoral Nord de la Baie-des-Chaleurs.
L'embouchure du barachois est délimitée par une bande de terre de 1,1 km s'avançant vers le nord-ouest à partir du hameau « Bonaventure-Est » et une autre pointe de terre s'avançant vers l'est sur 1,3 km à partir du centre-ville de Bonaventure jusqu'à la Pointe de Beaubassin. L'embouchure du barachois est située à :