Le président François Mitterrand a été, en , le premier dirigeant occidental à se rendre en Estonie, après le rétablissement de relations diplomatiques. Le président Jacques Chirac y a effectué une visite officielle en 2001. Le président Toomas Hendrik Ilves a été reçu à l’Élysée par le président français en , la présidente Kersti Kaljulaid en et le président Emmanuel Macron s’est entretenu avec elle à Tallinn en septembre 2017 lors du sommet numérique de Tallinn.
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