Le territoire de la commune de Queilén se répartit entre l'Isla Grande de Chiloé dont elle occupe une faible fraction et la totalité de l'île de Tranquis au sud du Chili. Ces îles donnent sur la mer intérieure (plus précisément dans le golfe de Corcovado) qui se trouve entre l'Isla Grande de Chiloé et le continent. La commune est située à 1 056 kilomètres à vol d'oiseau au sud de la capitale Santiago et à 146 kilomètres au sud-sud-ouest de Puerto Montt capitale de la Région des Lacs.
Historique
Les espagnols s'implantent sur le territoire de la commune en 1778 en créant Puerto Grille.