Dans les années 1950, la communauté est connue sous le nom de Koartak. En 1961, la communauté est renommée Notre-Dame-de-Koartac, dans le cadre d'une opération de francisation des toponymes du Nouveau-Québec. En 1980, le village prend officiellement le nom Quaqtaq[2].
Quaqtaq est aussi le nom d'une terre réservée inuit.
La toponymie du village signifie « ver intestinal »[3].
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On recense les premiers habitants aux alentours de Quaqtaq il y a environ 3 500 ans.
La présence de quelques familles est constatée à Cape Hopes Advance à partir de 1916, et à la baie Diana en 1920, alors qu'Herbert Hall y établit un poste de traite privé. Le détroit d'Hudson constitue un endroit de prédilection pour les chasseurs inuits, y trouvant des phoques et des bélugas en abondance.
Le record de vent le plus fort de l'histoire du Québec (201,1 km/h) a été enregistré près de Quaqtaq, le 18 novembre 1932[4]. Dans les années 1960, la population de Kangirsuk envisage la possibilité de se déplacer vers Quaqtaq[2].
Le premier centre de soins infirmiers est fondé en 1963. S'ensuivra la construction d'un magasin et d'un bureau de poste pendant la même décennie[5]. La communauté est constituée en village nordique en 1980[2]. En 1996, le Corps de police régional Kativik commence à assurer les services policiers pour le village[6].
↑Institut de la statistique du Québec. Population selon la langue parlée le plus souvent à la maison, municipalités et TE du Nord-du-Québec et ensemble du Québec, 2011
↑« Our Schools. » Kativik School Board. Retrieved on September 23, 2017.