C'est l'histoire de deux adolescents, Utsutsu et sa petite sœur Yume. Durant leur enfance, leur père Shirō les battait. Lorsque leur mère Sachiko divorce, elle part avec un autre homme, laissant ses enfants seuls. Utsutsu promet alors de protéger sa sœur coûte que coûte.
Un jour, alors qu’ils rentrent ensemble du collège, ils tombent nez-à-nez avec une étrange scientifique au visage mutilé, Maria, qui leur dit de faire attention aux papillons rouges. Juste après leur rencontre, de gigantesques papillons rouges apparaissent et Yume se transforme en monstre. Son frère, incapable de la ramener à la raison, est obligé de demander de l’aide à Maria, qui leur dévoile qu'ils sont infectés par un virus appelé pupa.
Utsutsu Hasegawa est le grand frère de Yume Hasegawa. Il se soucie énormément de sa sœur et fera tout pour elle, y compris en la laissant le manger pour éviter qu'elle ne tue davantage de personnes. Normalement, il est agréable et sympathique avec beaucoup de personnes. Cependant, après avoir été infecté par le virus Pupa qui lui donne une régénération d'une vitesse incroyable, un autre côté a émergé, un côté plus violent et sans pitié comme un effet secondaire.
Yume Hasegawa est une jeune fille, la petite sœur d'Utsutsu Hasegawa. Elle se soucie aussi beaucoup de son frère. Après l'infection et la transformation de Yume, celle-ci se met à dévorer son frère qui est immortel. Ce qui paraît étrange, c'est que la petite Yume se transforme en monstre mais pas son frère alors qu'ils sont tous les deux infectés par le virus Pupa.
En France, Coyote magazine, qui compare Pupa à Ajin, juge que « ce premier opus [...] semble prometteur mais manque finalement cruellement d'envergure »[5].
Anime
L'adaptation en série télévisée d'animation est annoncée en [6]. Celle-ci est produite au sein du Studio Deen avec une réalisation de Tomomi Mochizuki[7]. Initialement prévue pour l'automne 2013[8], la série est diffusée du au [9] et comporte douze épisodes courts. Dans les pays francophones, la série est diffusée en simulcast par Dybex[10].