Elle diffère de l'isocytidine par la présence d'une liaison osidique C–C au lieu d'une liaison C–N, comme c'est également cas pour la pseudouridine. Il en existe deux tautomères, notés 1H et 3H selon l'atome d'azote hydrogéné dans le cycle pyrimidine[2].
↑(en) Lou-Sing Kana, W-C. Lina, R. Dayal Yadava, J. H. Shiha et Ito Chaoa, « NMR Studies of the Tautomerism in Pseudoisocytidine », Nucleosides and Nucleotides, vol. 18, nos 4-5, , p. 1091-1093 (DOI10.1080/15257779908041655, lire en ligne)