Le siège épiscopal de Säben près de Klausen (Chiusa) existait jusqu'à environ l'année 960; il faisait partie du premier duché de Bavière et était suffragant de l'archidiocèse de Salzbourg. Le , le roi Louis IV de Germanie fit don du domaine de Prichsna, étant propriété de sa mère Oda, à l'évêque Zacharie. Ce manoir, devenu Brixen, deviendra le siège de l'évêché.
Les évêques avaient pu en 1004 déjà s'assurer d'importants droits du comtes dans la vallée de l'Isarco (Velthurns) et dans le val Pusteria (Bruneck), conférés par le roi Henri II. C'est en l'an 1027 que naît la principauté épiscopale : c'est à cette date que Conrad II le Salique sépare des territoires du duché de Bavière pour les donner à l'évêque Hartwig de Brixen. En cadre de leur politique italienne, les souverains du Saint-Empire se sont assurés ainsi un sauf-conduit à travers les Alpes. En 1179, l'évêché acquit le droit d'émettre sa monnaie ainsi que le droit de péage par l'empereur Frédéric Barberousse.