Le président de la République est élu au suffrage universel pour un mandat de sept ans. La constitution de 1982 lui accorde de larges pouvoirs; il peut ainsi nommer et renvoyer les ministres, modifier des lois ou en introduire de nouvelles par décret et dissoudre le parlement.
Le Premier ministre est nommé par le président de la République. Il coordonne les activités du gouvernement, sauf dans les domaines des affaires étrangères, de la défense nationale et de la sécurité.
Pouvoir législatif
Le parlement (chambre des représentants du peuple) est jusqu'en 2013 monocaméral, comptant 100 membres élus pour cinq ans à la proportionnelle dans des circonscriptions à sièges multiples.
La Guinée équatoriale est un État multipartite depuis 1991, où le Parti démocratique de Guinée équatoriale détient le pouvoir. D’autres formations mineures sont autorisées, mais à la condition de reconnaître la seule autorité du PDGE.
La Cour suprême est la plus haute instance judiciaire du pays. Ses juges sont nommés par le Président. Aux instances inférieures se trouvent les cours d’appel et les tribunaux locaux.
Le droit coutumier tient une place importante, lorsqu’il n’entre pas en conflit avec la loi écrite. Le système judiciaire combine des éléments de justice civile, traditionnelle et militaire et ne dispose pas de cadre procédural clair.