Pertti Paasio sort diplôme de l'université de Turku en 1968. Il est élu au conseil municipal de Turku en 1965. Il entre au Parlement en 1975, mais perd son siège lors des élections législatives de 1979. En 1982, il redevient député en remplacement de Jacob Söderman et conserve son siège jusqu'en , lorsqu'il est élu au Parlement européen. Il y siège jusqu'en 1999[1].
Suivant les traces de son père, il succède à Kalevi Sorsa à la tête du Parti social-démocrate en 1987, puis comme ministre des Affaires étrangères et suppléant du Premier ministre à partir du dans le gouvernement Holkeri. À la suite de la défaite de son parti aux élections législatives de 1991, Pertti Paasio abandonne la direction du parti social-démocrate.