Il a étudié à l'Université de Bâle comme élève de Ludwig Ruetimeyer et Friedrich Zschokke. Il a ensuite poursuivi ses études à Genève, où il a été persuadé par le zoologisteKarl Vogt de concentrer ses études sur les vers plats parasites. En 1894, il a obtenu son doctorat avec une thèse intitulée "Die Turbellarien der Umgebung von Basel". Après un passage en tant qu'assistant à l'Université de Genève, il a rejoint l'Université de Neuchâtel, où il a enseigné l'anatomie comparée et la zoologie de 1895 à 1941[1].
Il est l'auteur de l'introduction d'un nouveau schéma de classification pour des cyclophyllidea (de l'ordre de ténias), dans lequel la l'ordre a été divisée en dix familles avec huit sous-familles — de ses 66 genres, 20 étaient nouvelles pour la science. Le genre herpétologiqueCryptobatrachus fuhrmanni (la "grenouille sac" à dos de Fuhrmann) a été nommé en son honneur par Mario Giacinto Peracca[2].