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Le premier concert de la formation qui va être appelée le Houston Symphony Orchestra est donné le grâce au soutien financier d'Ima Hogg. Initialement, en raison de son faible budget, les 35 musiciens ne sont pas permanents de l'orchestre.
Dissous en 1918, l'orchestre recomposé en 1930 garde sa composition semi-professionnelle.
Au printemps 1936, le Houston Symphony Society est officiellement créée et l'embauche de musiciens professionnels commence. Depuis 1966, l'orchestre se produit au Jesse H. Jones Hall for the Performing Arts situé dans le centre de Houston.
En 2001, la tempête tropicale Allison a fait perdre des millions de dollars à la formation en raison des nombreux instruments, partitions et archives endommagés.