Né à Saugues (Gévaudan, dans l'actuel département de la Haute-Loire), Chabanel entra au noviciat jésuite de Toulouse à l'âge de dix-sept ans, puis il fut professeur de rhétorique dans plusieurs collèges jésuites. Il était très estimé pour sa vertu et sa sagesse. En 1643, il fut envoyé en Nouvelle-France, et après avoir étudié la langue algonquine pendant un certain temps, il fut nommé à la mission de Sainte-Marie, où il demeura jusqu'à sa mort.
Dans ses tâches apostoliques, il fut le compagnon du père Charles Garnier. Ayant ressenti une répugnance pour le mode de vie des Hurons, et craignant que cela ne pût affecter la qualité de son travail, il jura de ne plus jamais quitter la mission.
Chabanel fut assassiné le par un Huron nommé Louis Honarreennha.
Hommages
Canonisation
Il a été canonisé par le pape Pie XI le aux côtés des sept autres martyrs canadiens.