Né le à Pittsburgh en Pennsylvanie, Gaughan a été ordonné prêtre catholique le pour le diocèse de Greensburg.
Le il est nommé évêque titulaire de Taraqua(de) et évêque auxiliaire de Greensburg par le pape Paul VI. Il a été ordonné évêque par Mgr William G. Connare de Greensburg. Les évêques Cyrille Vogel, de Salina et John McDowell évêque auxiliaire de Pittsburgh, ont été les principaux co-consécrateurs.
Le Jean-Paul II le nomme deuxième évêque de Gary, dans l'Indiana. Il a servi le diocèse de Gary en tant qu'évêque 12 ans en tout[2]. En , l'évêque Gaughan a subi un grave avc. En raison de son état de santé, le pape a nommé Dale Melczek, alors évêque auxiliaire de l'archidiocèse de Détroit, pour être administrateur apostolique du diocèse. Le , le pape a nommé Mgr Melczek pour être évêque coadjuteur du diocèse de Gary.
Démission et mort
Le , le Saint-Siège a accepté la démission de l'évêque Gaughan[3]. Bien que vaillant dans ses tentatives pour continuer à servir le peuple de son diocèse, il a passé les dernières années de sa vie à la Maison Saint Anthony à Crown Point. Il est décédé le et a été inhumé au cimetière du Couvent Saint Emma Couvent à Greensburg en Pennsylvanie, après une messe d'obsèques à Gary.