Originaire de Fréjus, Nicolas Krakowski intègre le centre de formation de Saint-Raphaël Var Handball avant de passer professionnel au sein du club provençal en 2007. Fidèle à son club par ailleurs présidé par son père, Jean-François Krakowski, il subit trois opérations importantes au tibia entre 2016 et 2018 nécessitant une greffe osseuse. En 2018, il subit une opération au talon d'Achille. Il considère ne jamais avoir récupéré de ses blessures et, après quatorze saisons au SRVHB, décide de tirer sa révérence en tant que joueur professionnel en 2021.