Tandis que la neurochimie n'est reconnue comme une science que depuis récemment, l'intérêt pour la chimie du système nerveux remonte au XVIIIe siècle. À l'origine, le cerveau et le système nerveux périphérique étaient pensés comme deux entités à part entière. À partir de , une série de recherches identifie que la constitution des deux entités est pratiquement identique et contredit donc cette idée[1]. Le premier bond en avant dans l'histoire de la neurochimie vient de Johann Ludwig Wilhelm Thudichum(en), pionnier de la « chimie du cerveau », qui émet l'hypothèse que nombre de maladies neurologiques sont dues à une perte de l'équilibre de molécules dans le cerveau. Il fut également l'un des premiers à croire qu'à travers l'usage de molécules, la grande majorité de ces maladies neurologiques pouvaient être traitées, si ce n'est soignées[2].