Mannan était secrétaire général du Conseil consultatif islamique et du Conseil régional pendant l'administration d'Ayub Khan.
Opposition à l'indépendance du Bangladesh
Le , sous la direction de Mannan, un groupe d'enseignants de la madrasa a rencontré l'émir Abdullah Khan Niazi. Lors de cette rencontre, Mannan a remis un exemplaire du Coran au général Niazi et a déclaré qu'ils étaient prêts à soutenir l'armée pakistanaise pour préserver la sécurité du Pakistan et la gloire de l'Islam[1].
Mannan aurait été impliqué dans l'enlèvement et le meurtre du médecin AFM Alim Chowdhury[2].
Après 1971
Après l'indépendance, il est devenu le président du Jamiat-e-Mudarressin Bangladesh, une organisation d'enseignants de madrasa et le fondateur du Daily Inqilab, un des journaux les plus diffusés du pays[3],[4]. Dans Saptahik Bichitra (un hebdomadaire), Mannan a nié avoir été membre du comité pour la paix et a affirmé qu'il n'avait fait aucune déclaration en faveur de l'armée pakistanaise et du génocide commis par celle-ci[1].
L'hôtel Intercontinental et l'hôpital Holy Family ont été déclarés zone neutre par le gouvernement le . Mannan s'est réfugié dans l'une de ces zones[6].
Dans un rapport publié en , une commission d'enquête populaire a identifié, outre Ghulam Azam, huit autres personnes comme étant les collaborateurs d'Al-Badr dans les atrocités. Abdul Mannan était l'un de ces collaborateurs identifiés[5].
Shyamoli Nasrin Chowdhury, épouse de l'AFM Alim Chowdhury, affirme qu'Abdul Mannan était responsable de la mort de son mari[7]. Elle a déposé une plainte contre lui. Abdul Mannan, qui a pris la fuite, a été arrêté par la police du quartier Azimpur de la ville de Dacca. Mannan a avoué que trois membres de l'Al-Badr qui étaient ses étudiants ont emmené le Dr Abdul Alim Chowdhury[8],[9].
Mannan a été emmené à la prison centrale de Dacca le . Il a été libéré pour une raison inconnue et est entré dans la clandestinité[10].
Mort
Mannan est mort de complications liées à son âge le dans sa résidence de Banani à Dacca[4]. Ses funérailles ont eu lieu le jour suivant au complexe de la mosquée Gausul Azam à Mohakhali(en) et il y a été enterré[3].