Le département de Misiones est une des 17 subdivisions du Paraguay. Sa capitale est la ville de San Juan Bautista.
L'origine du nom vient de l'ancienne Mission jésuite du Paraguay qui s'implanta dans le centre du département. Dans la plupart des villes existent des musées avec d'importantes collections d'art religieux.
La principale activité économique de la région est l'élevage de bétail, ce qui explique la faible densité de population du département.