Milan Martić a exercé des responsabilités de chef de la police à Knin, durant l'administration yougoslave. Après la création, en , d'un « Conseil national serbe » créé en réaction à la victoire des nationalistes croates aux élections parlementaires croates tenues aux mois d'avril et mai, puis la proclamation par Milan Babić d'une « Région autonome serbe de Krajina », Milan Martić organise une milice paramilitaire serbe au service de l'entité autoproclamée, qui se mue le en république serbe de Krajina, non reconnue par la communauté internationale et dont Milan Babić prend la tête.
Entre la naissance de la république serbe de Krajina en 1991 et son effondrement en , Milan Martić occupe divers postes de responsabilité au sein des institutions de la RSK.
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