Comme de nombreux autres religieux, il fut d'abord arrêté et torturé, puis enfermé dans des couvents, à Włocławek, Ląd, et Berlin avant d'être déporté au camp de Dachau le .
Il y reste presque deux ans, assurant son ministère auprès des autres déportés.
Très affaibli, il fut achevé par une injection, le à l'infirmerie du camp.
Béatification - Fête
Michel Kozal fut béatifié le , par le pape Jean-Paul II à Varsovie lors de la clôture solennelle du congrès eucharistique. Le pape a dit de lui qu'il le considérait comme un martyr ayant témoigné d'une fidélité inébranlable au Christ.
