Melchior von Meckau étudie à Leipzig et à l'université de Bologne. Il est prévôt à Magdebourg, doyen du chapitre de Meissen et chanoine à Bressanone. En 1482 il est nommé coadjuteur de Bressanone avec droit de succession, où il succède en 1489. Vers 1490 il est nommé chanoine au Saint-Lambert de Liège. Les arts, l'architecture et la littérature florissent à Bressanone pendant son pontificat et on l'appelle le premier évêque humaniste.
Le pape Alexandre VI le crée cardinal lors du consistoire du . Le cardinal Meckau ne participe pas au premier conclave de 1503, lors duquel Pie III est élu, mais il participe au deuxième conclave de 1503, avec l'élection de Jules II. L'empereur le nomme ambassadeur auprès du pape Jules II et il exerce plusieurs missions pour l'empereur.