En , il est percuté par un camion en Irlande durant une séance d'entraînement. Il se cassé les deux jambes mais il peut reprendre sa carrière en conservant son contrat avec l'équipe belge Profel. Il se fait engager en 2009 dans l'équipe dirigée par Sean Kelly, An Post-Sean Kelly. Il met du temps à retrouver son niveau, mais ne songe toujours pas à s'arrêter.
Il choisit la nationalité irlandaise avant la saison sur piste 2009-2010 et fait ses débuts avec succès en terminant quatrième de la course scratch de la Coupe du monde de Manchester en .
Rolf Aldag, manager de l'équipe américaineTeam HTC-Columbia recrute Matthew Brammeier dont il souligne le caractère, après avoir retrouvé son niveau à la suite de son accident deux ans plus tôt. Il signe un contrat d'une année et roule aux côtés de Mark Cavendish et de Matthew Goss entre autres[1].
À la suite de l'arrêt de cette équipe, il s'engage pour 2012 avec l'équipe Omega Pharma-Quick Step où il roule pour Tom Boonen et retrouve notamment ses anciens coéquipiers Tony Martin, František Raboň ou encore les frères Martin et Peter Velits. Il quitte l'équipe à la fin de l'année, découvrant par un article de journal qu'il n'est pas conservé pour la saison prochaine. Il passe les deux saisons suivantes à courir pour l'équipe chinoise Champion System puis l'équipe azérie Synergy Baku Project[2].
En , il remporte pour la quatrième année consécutive le titre de champion d'Irlande. En 2015, il rejoint l'équipe sud-africaine MTN-Qhubeka. En juin, il gagne en solitaire la dernière étape du Ster ZLM Toer. Début août, il percute violemment une voiture à plus de 70 km/h lors du Tour de l'Utah, après avoir manqué un virage dans une descente. Il souffre de plusieurs côtes cassées, un pneumothorax ainsi qu’une fracture d'un os du bassin[3].
En 2017, il signe avec l'équipe continentale professionnelle irlandaise Aqua Blue Sport. Le , il annonce mettre un terme à sa carrière de coureur. Il devient entraîneur principal de British Cycling pour le programme d'endurance masculin[2].
↑Bien que courue sur une distance officielle pour être appelée prologue par l'UCI, la première étape est considérée par celle-ci comme une étape en contre-la-montre normal