Le , Matheus Reis est prêté à l'EC Bahia[1],[2]. Il joue son premier match pour le club le 14 mai 2017, lors d'une rencontre de championnat contre l'Athletico Paranaense. Il est titularisé et son équipe s'impose par six buts à deux[3].
Le , Matheus Reis rejoint le club portugais du Rio Ave FC[6].
Il joue son premier match sous ses nouvelles couleurs le , à l'occasion d'une rencontre de Ligue Europa 2018-2019 contre le Jagiellonia Białystok. Il est titularisé lors de cette rencontre perdue par son équipe (1-0 score final)[7]. Il fait sa première apparition dans le championnat portugais le , face au CD Tondela. Les deux équipes se neutralisent ce jour-là (1-1 score final)[8].
Sporting CP
Le , Matheus Reis est prêté jusqu'à la fin de la saison au Sporting CP[9].
Il joue son premier match pour le Sporting le , face au Gil Vicente FC, en championnat. Il entre en jeu à la place de Zouhair Feddal et son équipe l'emporte par deux buts à un[10]. Il est sacré champion du Portugal en 2021[11].
En , Matheus Reis rejoint définitivement le Sporting, signant un contrat courant jusqu'en juin 2025[12].
Il inscrit son premier but pour le Sporting le , lors d'une rencontre de championnat face au FC Famalicão. Son équipe l'emporte par deux buts à zéro ce jour-là[13].