Représentée par l'agence AAW de Catherine Winckelmuller[2], elle entre, en 1986, au journal ELLE comme rédactrice en chef du magazine[3],[4] puis en 1996, y redevient grand reporter et éditorialiste[5]. Elle a interviewé entre autres: Simone Veil[6].
En 2001, elle déclare, à l’AFP, être « indignée par l’unanimité des réactions internationales et médiatiques concernant la destruction des bouddhas géants de Bamiyan alors qu’il n’y a jamais eu une telle unanimité à propos de la condition des femmes afghanes » et dénonce « la négation d'un sexe par l'autre »[7].
En 2007, la publication de Maintenant, son livre d'entretiens avec Ségolène Royal, entraine une vive négociation entre Hachette Littératures et Flammarion[10],[11]. En 2009, selon Arrêt sur image, elle est quasiment la seule voix à s'élever contre Alain Finkielkraut critiquant l'arrestation de Roman Polanski. Elle estime que le philosophe s'est exprimé « comme un macho de la pire espèce »[12]. Elle confie lors d’une intervention à l’École du Bondy Blog, dont elle a été une des marraines : « Un édito, ça déclenche les passions. On ne reçoit jamais de compliments mais les critiques… énormément. C’est très engageant. Mon éditorial sur l’affaire Polanski[13] est celui qui a déclenché le plus de réactions… On est aussi jugé par ses pairs.[14] »
En 2017, elle publie un livre d'entretiens avec l'imam de Bordeaux Tareq Oubrou, La Féministe et l'Islam.
En février de la même année, Alexandre Devecchio, dans un article du Figaro concernant les tweets racistes, antisémites, homophobes et misogynes, publiés entre 2011 et 2015, sous pseudonyme par Mehdi Meklat, rappelle qu'elle a été parmi les personnes à soutenir et lancer la carrière de ce dernier, en 2010[19],[20],[21], dont s'inspire le réalisateur Laurent Cantet, dans son film Arthur Rambo, sorti en 2022.
Marie-Françoise Colombani s'intéresse principalement à la cause féministe et à la question migratoire[23].
En , avec Chékéba Hachémi et une équipe de rédaction du Magazine ELLE, elle se rend en Afghanistan pour la création de ROZ (signifiant “le jour” en persan), premier magazine féminin afghan : 36 pages où les conseils pratiques se mêlent à l’éducation, l’information juridique, la poésie. Ce magazine est réalisé en collaboration avec une équipe de journalistes afghanes qui en prendra les rênes par la suite. ROZ paraîtra pendant de longues années grâce au soutien financier du groupe Hachette via la fondation ELLE[24].
Début 2009, avec la diplomate Chékéba Hachemi, elle crée l'agence de conseil EpOke, spécialisée dans l'étude, la conception et la réalisation de projets sociétaux pour les acteurs publics et privés. En collaboration avec le magazine ELLE, EpOke a publié en 2012, 2013, 2014 l'ouvrage Le Guide des Expertes (Éditions Anne Carrière) qui rassemble 500 noms de femmes expertes susceptibles d'intervenir dans les médias[25]. Afin de renforcer la place des femmes dans la société et de leur donner plus de voix, ce guide a été envoyé aux rédactions de journaux et aux programmateurs des chaînes n'invitant pratiquement que des hommes. En 2015, EpOke confie au groupe EgaéLe Guide des expertes, devenu Projet Expertes.eu, plateforme numérique de dimensions internationales.
En 2016, elle écrit le livre Bienvenue à Calais: les raisons de la colère avec les illustrations de Damien Roudeau pour “refuser la honte, dénoncer l’intolérable, sortir des chiffres et des termes génériques: migrants, réfugiés, ou le moins connu «dublinés»”[28] . L’ensemble des bénéfices et droits d’auteurs sont reversés à l’Association l’Auberge des migrants[29].
