1 Compétitions officielles nationales et internationales senior, incluant le parcours amateur et en équipe réserve. 2 Matchs officiels. Dernière mise à jour : 30 juin 2015
En , il rejoint l'Europe et le Recreativo de Huelva où il se révèle être un excellent arrière gauche. En 2004, Pernía s'engage avec Getafe. Il y passe deux saisons prolifiques, inscrivant notamment dix buts en championnat lors de la saison 2005-2006.
En 2006, le latéral gauche signe à l'Atlético Madrid. Malgré de bons débuts avec les Colchoneros, Pernía peine à s'imposer réellement dans le club. Néanmoins, il connait pour la première la compétition européenne en participant à la Coupe UEFA lors de la saison 2007-2008 puis la Ligue des champions la saison suivante, malgré des parcours difficiles. En 2010, Pernía quitte les madrilènes après avoir pris part à 105 matches pour un but.
L'Argentin finit difficilement sa carrière, rejoignant le Club Nacional en Uruguay. Il ne prend joue que sept rencontres et décide de quitter le club en , trois mois après son arrivée. Le défenseur s'engage avec Tigre, dans son pays natal, son dernier club. En 2012, Pernía met un terme à sa carrière de footballeur.
En sélection
En 2006, Pernía obtient la nationalité espagnole et décide de représenter les couleurs de la Roja. Il marque son seul but en sélection contre la Croatie (victoire 2-1) en . Ses bonnes prestations en club lui permettent de participe à la Coupe du monde 2006. L'Espagne échouera en huitième de finale face à la France de Zidane (1-3)[2].
