Les quatre Beatles partent à travers la campagne anglaise dans un voyage organisé, le Magical Mystery Tour. Un grand nombre d'aventures insolites vont arriver aux protagonistes. Il s'agit plus de la trame d'un film à sketchs que d'une histoire à proprement parler.
Seul Ringo et sa tante Jessie, les organisateurs, ainsi que M. Bloodvessel, un vieillard se prenant pour le guide, sont utilisés pour faire passer le spectateur d'une histoire à une autre. La narration est effectuée par John Lennon.
Le 7 avril 1967, Paul McCartney rejoint sa compagne, l'actrice Jane Asher, à Denver dans le Colorado pour fêter son 21ème anniversaire. Lors de ce séjour, il repense à l'histoire qu'il avait entendue sur un écrivain américain, Ken Kesey, et son épopée dans un bus sans destination avec une troupe de hippies, les Merry Pranksters. Il se dit qu'un voyage similaire, replacé dans un contexte britannique pourrait servir de base solide au prochain long-métrage des Beatles[2].
La première diffusion a lieu le mais en noir et blanc sur la BBC One. Bien qu'elle attira près de 20 millions de téléspectateurs, la plupart furent plutôt confus et déçus par l'œuvre[4]. Ce fut un flop retentissant, notamment parce que l'absence de couleurs ne permettait pas de rendre correctement son style psychédélique. La télévision française refusa pour sa part le film. On a dû attendre le 14 décembre 2012 pour finalement le voir sur les ondes américaines lorsque la PBS présenta la version restaurée, précédée du documentaire Magical Mystery Tour Revisited[5], bien qu'il fût présenté dans des cinéma de répertoire durant les années 1970.
Les différentes chansons interprétées par le groupe sont publiées en Angleterre dans le double maxidu même nom tandis qu'en Amérique du Nord on les place sur un 33 tours augmenté des singles sortis durant l'année 1967. Des pièces de musique d'ambiance sont inclus dans le film, dont She Loves You jouée au limonaire avant la scène du marathon et une version orchestrale de All My Loving durant le rêve de la tante Jessie.
Il est également probable que le film trouve une partie de son origine dans le livre de Tom Wolfe : Acid Test qui décrit le voyage à travers les États-Unis d'un groupe de hippies.
Une réédition du film est parue le partout dans le monde et le lendemain en Amérique du Nord. Le DVD et le disque Blu-Ray contiennent en supplément des scènes coupées et des montages vidéo inédits de certaines des chansons. De plus, le , le film est présenté pour la première fois au cinéma.