En 1968, il passe derrière la caméra et dirige Vonetta McGee, Enzo Cerusico et Renzo Montagnani dans la comédie Faustina. En 1969, Magni remporte un succès extraordinaire avec Les Conspirateurs, qui est le film italien le plus populaire de l'année, au point de nécessiter pour la première fois en Italie des projections nocturnes pour répondre à la demande du public. Ce film définit la marque de fabrique de son réalisateur : une comédie dramatique se déroulant dans la Rome papale à l'époque du Risorgimento[3], oscillant entre la farce et le drame, sans oublier la dimension romaine de l'intrigue. Ce film marque le début de sa collaboration avec Nino Manfredi[1].
En 2004, il reçoit le prix du film Stupor Mundi au festival du film de Trani, un prix pour l'ensemble de sa carrière inspiré de la figure de Frédéric II de Souabe, tandis qu'en 2008, il reçoit un David di Donatello spécial pour célébrer ses 80 ans et ses 40 ans d'activité en tant que metteur en scène.
En septembre 2017, le Prix national Luigi Magni pour le graphisme a été créé à Velletri à l'initiative du Circolo artistico La Pallade Veliterna. Le , la municipalité de Velletri a dédié au réalisateur une avenue dans la Villa Ginnetti. En 2018, toujours à Velletri, un musée a été inauguré, consacré à sa carrière et rassemblant des prix, des accessoires, des scripts et des scénarios originaux. En 2020, la « Fondation du musée Luigi Magni et Lucia Mirisola » a été créée.
Le , la municipalité de Rome a donné le nom de Magni au belvédère du Jardin des orangers, sur la colline de l'Aventin[7].
