En 2018, Pfeiffer est relégué en championnat avec le Kickers puis rejoint le SC Paderborn 07 qui vient d'accéder à la 2. Bundesliga. Cependant, l'attaquant a été immédiatement prêté au VfL Osnabrück, club de 3. Liga. Le , Pfeiffer fait ses débuts professionnels lors du match à l'extérieur au Hallescher FC lorsqu'il entre à la place de Marcos Alvarez. À la fin de la saison, le VfL Osnabrück est champion et accède à la 2. Bundesliga.
Après l'expiration de son contrat de prêt, l'attaquant ne retourne pas à Paderborn au printemps 2019, le club le vend plutôt au FC Würzburger Kickers, pour 1.5 million d'euros, où il reçoit un contrat valable jusqu'en . Avec 15 buts cette saison, il joue un rôle clé dans l'accession de Wurtzbourg, deuxième, en 2. Bundesliga.
Le , dernier jour du mercato estival, Luca Pfeiffer rejoint le Football Club Midtjylland, champion du Danemark 2020 et qualifié pour la Ligue des champions, avec un contrat jusqu'en . Le FC Midtjylland commence lors du deuxième tour de qualification et finit dernier du groupe D ; Pfeiffer participe à trois matchs pour 16 minutes de jeu, lors d'un remplacement à la fin du match à l'extérieur face au Liverpool Football Club[1].
