Christophe Colomb découvrit l'île le et s'en empara au nom de l'Espagne. Il la baptisa Las Tortugas en référence aux nombreuses tortues qui la peuplaient.
L'île fut colonisée au début du XVIIe siècle, puis abandonnée en 1671 à la suite d'un raid de corsaires espagnols. Little Cayman deviendra britannique en 1670 au terme du traité de Madrid.
En 1833, une nouvelle colonie fut établie sur le site de Blossom Village.