La plus connue et plus ancienne d'entre elles est la mosquée Zitouna, située au centre de la médina de Tunis, formant ainsi le noyau de la cité.
Désormais, il existe de nombreuses mosquées à travers la ville par suite de la croissance et de la diversification de sa population. Celle-ci a conduit à l'apparition de mosquées aux styles architecturaux variés.
Cette mosquée est la principale mosquée de la médina de Tunis et la plus ancienne de la capitale. Fondée en 698 sur ordre de Hassan Ibn Numan et finalisée par Abdallah ibn al-Habhab en 732, elle est considérée comme la deuxième plus ancienne mosquée du pays après la Grande Mosquée de Kairouan. La mosquée a longtemps constitué un poste défensif tourné vers la mer, deux tours de surveillance subsistant dans les angles nord-est et sud-est du bâtiment.
C'est aussi la plus grande de la ville : érigée sur une superficie de quelque 5 000 m2, elle est dotée de neuf entrées et possède 184 colonnes antiques provenant essentiellement du site de Carthage.
Cette mosquée est construite en 1655 par Hammouda Pacha, bey de Tunis, qui lui donne son nom. Elle est considérée comme un monument historique depuis le .
Le règne de ce bey a duré 35 ans, une durée suffisante pour lui permettre de bâtir de nombreux monuments civils et religieux, dont la mosquée.
Située sur la place de la Kasbah à Tunis, la mosquée du même nom est édifiée de 1231 à 1235 par l'architecte Ali ibn Mohamed ibn Kacem, sur ordre du fondateur de la dynastie hafside Abû Zakariyâ Yahyâ.
La mosquée El Hawa est édifiée sur les hauteurs occidentales de Tunis, dans le faubourg de Bab El Jazira. Elle est construite en 1252 sur instructions de la princesse hafside Atf.
Aussi connue sous le nom de mosquée Sidi Youssef, la mosquée Youssef Dey est la première à être construite sous le règne ottoman, soit en 1612, sous le règne de Youssef Dey. Elle abrite le tombeau de son fondateur.