Le , à l'occasion de l'ouverture de la ligne Shinkansen Hokuriku jusqu'à Kanazawa, la section de la ligne principale Shin'etsu entre Nagano et Myōkō-Kōgen est transférée de la JR East à Shinano Railway. La section devient la ligne Kita-Shinano[1].
Les trains de la ligne Iiyama empruntent la ligne entre Toyono et Nagano. A Nagano, quelques trains continuent sur la ligne principale Shin'etsu (services de la ligne Shinano Railway).
La ligne est également parcourue par des trains de fret.